Des chercheurs chinois ont développé des communautés microbiennes synthétiques qui améliorent la croissance des cultures et limitent les maladies transmises par le sol, offrant ainsi un nouvel outil potentiel pour une agriculture durable.
Une étude publiée dansRecherche horticolepar l'Institut d'agriculture subtropicale de l'Académie chinoise des sciences a examiné comment la monoculture-à long terme affecte le microbiome endophyte des lys comestibles. L'équipe a découvert que la culture continue remodèle la communauté microbienne à l'intérieur des tissus végétaux, enrichissant à la fois les agents pathogènes nocifs tels queFusarium oxysporumet des groupes bénéfiques, notammentPseudomonasetBacille. Ces organismes interagissent dans ce que les chercheurs décrivent comme un « équilibre antagoniste ».
L’analyse a également montré qu’environ la moitié des bactéries endophytes proviennent du sol, contre moins de 10 % des champignons, ce qui indique une forte pression sélective de la plante sur les espèces fongiques. À partir de bulbes de lys, l'équipe a isolé parmi eux des souches antagonistes principales-Rhizobium, Méthylobactérieet le champignonTalaromyces-assembler plusieurs consortiums microbiens synthétiques.
Dans les tests de croissance et de suppression d'agents pathogènes-, les consortiums multi-souches ont surpassé les isolats individuels. Les communautés comprenant à la fois des membres bactériens et fongiques ont montré les effets les plus forts contreFusariumet a produit de plus grands avantages de croissance pour les plantes hôtes.
Selon l'auteur correspondant, le professeur Zhu Baoli, les résultats clarifient la manière dont les systèmes de monoculture influencent les communautés endophytes et démontrent un cadre pratique pour l'ingénierie de consortiums microbiens ciblés afin de gérer la flétrissure fusarienne.
Les auteurs soutiennent que les SynComs conçus de manière rationnelle offrent une voie vers la réduction de la dépendance aux pesticides et la gestion du stress lié à la replantation dans les systèmes de production intensive, avec des implications plus larges sur la santé des sols et la gestion des cultures à faibles intrants.
