Alors que l’agriculture est confrontée à une pression croissante pour produire plus avec moins d’intrants, l’innovation en matière de protection biologique des cultures évolue à un rythme sans précédent. Micropep Technologies est à l'avant-garde de cette transformation avec sa plate-forme de découverte-alimentée par l'IA, Krisalix, conçue pour accélérer le développement de biosolutions à base de micropeptides-. Lors d'une récente conversation avec AgriBusiness Global, Mikael Courbot, directeur de la technologie chez Micropep Technologies, a expliqué comment l'IA remodèle la découverte, élargit le potentiel de la conception de peptides et redéfinit la manière dont de nouveaux modes d'action durables sont mis sur le marché.
Remodeler la découverte de la protection des cultures grâce à l'IA
L’intelligence artificielle ouvre de nouvelles possibilités en matière de rapidité et de précision des découvertes en matière de protection des cultures. Courbot explique que des plateformes comme Krisalix transforment l'ensemble du processus de développement en fusionnant l'IA générative et prédictive avec la biologie, la chimie et la fabrication dans un système unifié.
« Krisalix permet de passer de la conception d'une molécule à la validation en laboratoire en quelques semaines seulement au lieu de quelques mois », dit-il. "Cela signifie que nous pouvons accélérer les délais de découverte de nouveaux modes d'action pour les fongicides, les herbicides et les insecticides."
Contrairement aux outils d'IA à usage général-axés sur la génomique ou l'imagerie, Krisalix a été spécialement-conçu pour les biosolutions à base de peptides-. Il optimise les performances des molécules tout en prédisant la fabricabilité et la stabilité, capacités qui changent fondamentalement la manière dont les biocontrôles sont découverts et mis sur le marché.
"Cela représente bien plus qu'une simple accélération numérique", ajoute Courbot. "Cela marque une refonte fondamentale de la façon dont les futurs biocontrôles seront créés."
Élargir la conception des peptides au-delà des fongicides
Le premier biofongicide de Micropep, MPD-01, est la première validation majeure de la plateforme Krisalix par l'entreprise, mais ce n'est que le début. Courbot envisage un avenir beaucoup plus vaste pour la conception de peptides.
"Grâce aux capacités de modélisation de Krisalix, nous pouvons étendre la conception de peptides bien au-delà de la technologie des fongicides et des peptides antimicrobiens", explique-t-il. "Nous étudions les bioherbicides, les biopesticides et même la résilience et la nutrition des plantes."
Le moteur de criblage virtuel de Krisalix peut modéliser des millions de peptides candidats et classer les plus prometteurs en fonction de la dynamique de liaison, de l'efficacité et de la stabilité. "Tout ce dont nous avons besoin, c'est d'une cible protéique", explique Courbot. "La plateforme peut faire le reste en termes de génération de leads."
Étant donné que les peptides sont présents naturellement dans toutes les plantes et tous les organismes, le même cadre peut être appliqué à un large éventail de défis agricoles, du stress biotique provoqué par des ravageurs et des agents pathogènes au stress abiotique comme la chaleur ou la sécheresse. Au fil du temps, Courbot s'attend à ce que Krisalix devienne un moteur de conception central pour des intrants agricoles durables à base de micropeptides-qui sont plus sûrs, plus rapides à développer et facilement adaptables à toutes les cultures et à tous les climats.
Découvrir de nouveaux modes d'action
L'une des plus grandes forces de Krisalix réside dans sa capacité à aller au-delà des modes d'action connus et à prédire des interactions biochimiques entièrement nouvelles entre les peptides et leurs cibles protéiques. En combinant la prédiction de la structure des protéines-de--de pointe avec la génération de liants peptidiques basée sur l'IA-, la plate-forme peut simuler la manière dont les peptides interagissent avec des protéines spécifiques pour bloquer ou moduler leur fonction.
"Cela nous permet d'identifier des micropeptides dans plusieurs technologies", a déclaré Courbot. "Cela inclut les peptides antimicrobiens qui perturbent les membranes fongiques, les bloqueurs d'interactions peptidiques-protéiques et les micropeptides qui modulent la traduction des gènes."
Cette approche systématique est essentielle pour lutter contre la résistance et élargir la frontière de l’efficacité biologique. "En découvrant de nouveaux modes d'action", dit-il, "nous pouvons contribuer à garantir que la protection biologique des cultures continue d'évoluer parallèlement à l'évolution des défis agricoles."
Rationalisation des données pour l'enregistrement
L’IA n’accélère pas seulement la découverte : elle améliore également la rigueur et la traçabilité des données qui la sous-tendent. Courbot note que Krisalix améliore la reproductibilité et la transparence de la R&D sur les peptides grâce à des ensembles de données centralisés et à des pipelines MLOps robustes qui génèrent des paquets de données standardisés et traçables.
Grâce à l'intégration avec le moteur de connaissances ADOPT, toutes les données expérimentales sont centralisées pour garantir la reproductibilité et prendre en charge la création de dossiers-de haute qualité pour les soumissions réglementaires. "Étant donné que les cadres réglementaires pour les produits biologiques sont encore en évolution, il est crucial de disposer d'un processus-basé sur les données", explique Courbot. « Krisalix permet non seulement la création de meilleures molécules, mais également l'intégrité et la traçabilité des données dont les régulateurs ont besoin.
Regard vers l’avenir : l’IA comme catalyseur de l’innovation durable
Pour Courbot, les travaux chez Micropep ne font que commencer. "Les micropeptides représentent une nouvelle classe de biosolutions qui combinent la précision de la chimie avec la durabilité des produits biologiques", explique-t-il. « L'évolution rapide des systèmes d'IA comme Krisalix a rendu le processus de découverte dynamique. Nous apprenons et améliorons constamment les performances prédictives à chaque cycle.
À mesure que les collaborations de Micropep se développent avec des sociétés de premier plan telles que Corteva et FMC, Krisalix est sur le point de définir une nouvelle génération d'intrants agricoles se distinguant par leurs performances, leur sécurité et leur évolutivité.
"En fin de compte", conclut Courbot, "l'innovation peptidique basée sur l'IA- fera progresser l'agriculture vers un avenir plus productif, plus résilient et plus durable."
